Журнал был основан в 2008 году группой российских экспертов по медицинскому симуляционному обучению, представителей высшей медицинской школы и разработчиков медицинского симуляционного оборудования. Свидетельство о государственной регистрации средства массовой информации ПИ № ФС77-34673 получено 23 декабря 2008 года. С 2009 по 2019 год журнал издавался с полугодовой периодичностью, а с 2020 года – ежеквартальной. Со дня основания и по сей день журнал является единственным в мире специализированным изданием на русском языке, посвященном применению симуляционных и виртуальных технологий в медицинском обучении, тренинге, клинической практике, исследованиям и испытаниям. С 2012 года после создания Общероссийской общественной организации «Российское общество симуляционного обучения в медицине» (РОСОМЕД) и ее регистрации в Министерстве Юстиции Российской Федерации журнал «Виртуальные технологии в медицине» стал ее официальным печатным органом, журналом общества РОСОМЕД.